ของเสียในตู้ (ขี้ปลา เศษอาหาร ซากสิ่งมีชีวิต) จะกลายเป็น แอมโมเนีย ซึ่งเป็นพิษร้ายแรงต่อปลา ธรรมชาติแก้ปัญหานี้ด้วยแบคทีเรีย 2 กลุ่มที่ค่อยๆ เติบโตขึ้นในตู้ การ "ไซเคิลตู้" (Cycling) คือการรอให้แบคทีเรียเหล่านี้เติบโตจนเพียงพอ — ใช้เวลา 4–6 สัปดาห์ เป็นปกติ